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哈萨克族原发性高血压病患者全血 DNA 甲基化位点筛查及异常甲基化谱的构建

【作者】 <i> 由淑萍 从美丽 倪国华 詹怀峰 王红军 金晶 马登娥 叶力夏提 赵志强 蒋红 刘涛 新疆医科大学护理学院 新疆乌鲁木齐市 830000 新疆医科大学医学实验动物中心 新疆乌鲁木齐市 830054 新疆医科大学第一附属医院 新疆乌鲁木齐市 830054 830000 新疆乌鲁木齐市乌鲁木齐县甘沟乡卫生院 830000 新疆乌鲁木齐市乌鲁木齐县小渠

【关键词】 高血压 哈萨克族 DNA 甲基化 基因芯片

摘要】目的:应用基因芯片技术筛选哈萨克族原发性高血压病(EH)患者异常 DNA 甲基化位点,初步构建哈萨克族 EH 异常甲基化谱,为深入研究哈萨克族 EH 的发生机制提供理论依据。方法2014年6月—2015年10月,在新疆乌鲁木齐县随机抽取哈萨克族牧民或半农牧民3042例为调研对象,从其中的1487例 EH 患者中随机选取3例作为 EH 组,并选取年龄匹配的3例健康者作为对照组。采用 Illumina Human Methylation 450K BeadChip 芯片对两组受试者的全血进行全基因组 DNA 甲基化检测,筛选 DNA 异常甲基化位点,采用 Gene Ontology( GO)富集分析和Pathway 分析了解异常甲基化基因的功能。结果 EH 组和对照组间存在427个差异甲基化位点,其中高甲基化位点148个,低甲基化位点279个;这些位点位于不同的染色体上,其中以1号和6号染色体最多,Y 染色体未见差异甲基化位点;GO 富集分析结果显示,差异甲基化基因主要参与糖蛋白生物合成与代谢、血管发育、脉管系统发展、胶原蛋白结合等生物学过程;Pathway 分析结果显示,差异甲基化基因主要参与了硫酸软骨素生物合成、胰岛素信号通路、胞吞等。结论发生 EH 时 DNA 甲基化状态发生改变,多条差异甲基化基因与 EH 相关通路有关,但本研究仅是哈萨克族EH 全基因组甲基化谱的开端,异常甲基化基因作为发生 EH 的候选分子标志物,若要获得更全面、更精确的结果,还需要进一步扩大样本量进行分析及验证。

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