【摘要】目的了解新疆新型农牧区合作医疗（新农合）政策的实施现状及存在问题,为完善新农合制度提供相关建议。方法从新疆最早试点的13个县中,随机抽取6个县进行定量和定性调查。结果 2003—2009年样本县新农合的管理水平逐年增强,2009年较2005年筹资总额投入增加了262.02%,对新农合经办机构的拨款总额增长了54.43%,人员数均达到自治区编制标准;样本县新农合宣传工作力度逐年增强。参合农牧民住院及门诊补偿人次与补偿费用呈增长趋势,而门诊补偿比呈下降趋势;就诊患者对新农合政策总体满意者占76.87%;2009年各样本县农牧民参合率为98.65%~100.00%。结论政府应引导社会力量积极资助贫困农民参加新农合;建议增加各样本县新农合经办机构人员编制为6~9人,同时加大培训力度;加快新农合的信息化建设,提高新农合的管理能力和服务能力;依靠行政手段,实行多方参与,加大宣传力度。